Zelena predstavlja naravo in Ljubljansko barje, ob katerem lezi Škofljica.
Rdeča je barva prijateljstva in ljubezni.
Bela predstavlja čistost; “Skavt je čist v mislih, besedah in dejanjih,” pravi deseti skavtski zakon.
Črna ponazarja barjansko prst in s tem rodovitnost ter trdnost.
Rumena kot barva svetlobe govori o naši kulturni dediščini. Rumena nas namreč spomni na knjigo Frana Saleškega Finžgarja Pod svobodnim soncem, ki je nastala v neposredni okolici našega kraja.
Rumena obroba rutke pa simbolizira povezanost z Bogom. Rumena obroba povezuje vse barve na rutki, Bog pa povezuje med seboj skavte, da smo si res bratje in sestre.
